El Área de Contaminación Atmosférica (ACA) además de ser el Laboratorio Nacional de Referencia de Calidad del Aire y depositario del Patrón Nacional de Ozono actúa como laboratorio químico para la determinación de contaminantes atmosféricos para lo cual está acreditado para 154 ensayos en aire ambiente, soporte de muestreo de aire ambiente y precipitación (anexo técnico). En este contexto actúa como el laboratorio de la red mundial EMEP/VAG/CAMP y realiza campañas de medición de contaminantes atmosféricos en situaciones de riesgo para la salud, entre otras.

El ACA, además realiza otras actividades como la normalización de métodos de medición (métodos de referencia) de las Directivas Comunitarias de calidad del aire, evaluación de la calidad del aire en ambientes interiores, elaboración de mapas de riesgo y medidas de exposición personal a contaminantes atmosféricos, supervisión de las redes de calidad del aire y organización de ejercicios de intercomparación tango de gases como de partículas atmosféricas.