La misión específica de la UFIEC es desarrollar actividades de investigación básica y traslacional, diagnóstico diferencial y formación en enfermedades crónicas, constituyéndose así en un recurso de soporte científico-técnico para la prevención, diagnóstico y tratamiento de las enfermedades crónicas de mayor prevalencia en el contexto del Sistema Nacional de Salud. El objetivo de la UFIEC es convertirse en un Centro de Referencia en la Investigación Biomédica de las Enfermedades Crónicas de alcance nacional e internacional.