1.“Incidencia y caracterización genómica de Klebsiella pneumoniae y Escherichia coli productores de carbapenemasas aislados en hospitales españoles: Proyecto multicéntrico nacional CARB-ES-2019” Proyecto de Investigación en Salud ISCIII AESi 2018. Vigencia: 2019-2021. Proyecto: PI18CIII/00030. IP: Jesús Oteo.
2.“National health care infrastructures, health care utilization and patient movements between hospitals: Networks working to improve surveillance (NeWIS)”. JPIAMR for transnational networks 2018. Vigencia 2019-2020. IP: Hajo Grundmann. IP en España: Jesús Oteo
3.“Caracterización mediante secuenciación de genomas completos de los principales clones de Klebsiella pneumoniae productores de carbapenemasas en España” Proyecto de Investigación en Salud ISCIII. Ministerio de Economía y competitividad. Vigencia: 2016-2018. Proyecto: PI15CIII/00017. IPs: Jesús Oteo, María Pérez-Vázquez.
4.“Plan Estratégico y de Acción para reducir el riesgo de selección y diseminación de la resistencia a los antimicrobianos” Encomienda de gestión de la Agencia Española del Medicamento y Productos Sanitarios al ISCIII. Vigencia: 2015-2017. IP: Jesús Oteo.
5.“Population structure of multidrug resistant Escherichia coli isolates from complicated urinary tract infections and their susceptibility to ceftolozane-tazobactam and other antimicrobial agents”. Vigencia 2016-2017. Proyecto financiado por MSD. IPs: Juan Ignacio Alós, Jesús Oteo.
6.“Survey of carbapenem- and/or colistin resistant Enterobacteriaceae (CCRE survey)”. Proyecto promovido por el ECDC. IP: ECDC. Coordinadores responsables en España: Jesús Oteo, Belén Aracil
7.“Desarrollo preclínico de vacunas basadas en ADN plasmídico para la prevención de infecciones por Klebsiella pneumoniae y Acinetobacter baumannii multirresistentes” Proyecto de Investigación en Salud ISCIII AESi 2018. Vigencia: 2019-2021. Proyecto: PI18CIII/00018. IP: Michael McConnell, María Pérez Vázquez.
8.“Impacto de la hospitalización en UCI en el microbioma y resistoma gastrointestinal, estudio de cohorte observacional”. Programa de Ayudas destinadas a la atracción de talento investigador CAM, 2018. Proyecto: CAM,2018-T1/BMD-11581; ISCII, MPY337/19. IP: Silvia García Cobos.
9.“Análisis cuantitativo de la colonización intestinal por enterobacterias productoras de carbapenemasas”. Proyecto de Investigacion en Salud AES 2017. Vigencia:2017-2019. IP: Jesús Mingorance, IC: Belén Aracil.
10. “Otitis media aguda debida a Haemophilus influenzae no tipable: resistencia a antibióticos, estructura poblacional, virulencia y formación de biopelículas”. Agencia financiadora: Fondo de Investigaciones Sanitarias (FIS). Ministerio de Economía y Competitividad. Duración: 2013-2016. Expediente PI12/00780. IP: M Pérez-Vázquez.
11.“RETIC para la Investigación de Patología Infecciosa: REIPI”. RETICS FIS 2006. Fondo de Investigaciones Sanitarias (FIS). Ministerio de Sanidad y Consumo Vigencia 2007-2013. 1º Renovación Vigencia 2013-2016. 2ª Renovación Vigencia 2017-2021. IP Grupo: José Campos y Jesús Oteo.
12. “Estudio de los mecanismos implicados en la colonización y epidemicidad del patógeno nosocomial Klebsiella pneumoniae: búsqueda de nuevas estrategias para erradicar una infección”. Convocatoria SEIMC de investigación en Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica. Vigencia 2016. IP: Astrid Pérez, IC: María Pérez-Vázquez, Jesús Oteo.
13. “Impacto en salud pública de la dispersión de enterobacterias productoras de carbapenemasas en España: Caracterización molecular de las cepas circulantes”. Fondo de Investigaciones Sanitarias (FIS). Ministerio de Ciencia e Innovación. Vigencia 2013-2016. IP: Jesús Oteo.
14. “Caracterización de clones de enterobacterias con resistencia a múltiples antibióticos productores de carbapenemasas y resistencia a colistina en animales salvajes de la fauna autóctona” Colaboración con Grupo de Rehabilitación de la Fauna Autóctona y su Hábitat GREFA. Vigencia 2016-2017. IP ISCIII: Jesús Oteo.
15. European Union Joint Action on Antimicrobial Resistance and Healthcare-Associated Infections, EUJAMRAI. Investigador representando al CNM: Jesús Oteo.
16. Proyecto VAMPIRE (Vaccines And Monoclonal antibodies: Predicting the Impact on antimicrobial Resistance and Economic evaluation) IMI IINICIATIVES; IMI2 JU Annual Work Plan and Budget for 2020 approved by the IMI2 JU Governing Board on 19 June 2020.